Plant physiology, biochemistry and molecular biology

Genetic Diversity Analysis of Pitaya Germplasm Based on ISSR Markers and Quantitative Traits

  • CHEN Ming-xian
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  • (Quanzhou Institute of Agricultural Services, Jinjiang 362212, Fujian China)

Online published: 2022-08-03

Abstract

In order to identify the genetic relationship of pitaya germplasm materials, and screen excellent parents to improve breeding efficiency, ISSR molecular marker technology was used to study on the genetic background of 25 pitaya germplasm materials. After the data of 20 quantitative traits of plants and fruits standardizing, the genetic distance between varieties was calculated by Euclidean distance for comparative analysis. The results showed that 97 loci were detected by 7 ISSR primers, of which 93 were polymorphic, and the proportion of polymorphic bands was 95.88%. Based on UPGMA cluster analysis of molecular markers, 25 germplasm materials could be divided into 6 groups at the threshold of 0.54, and the similarity coefficients of various germplasm materials ranged from 0.41 to 0.86. The coefficient of variation of 20 quantitative traits ranged from 12.35% to 51.66%. Ward cluster analysis showed that 25 germplasm materials could be clustered into 6 groups at 5 Euclidean distances. The results of the two classification methods were not consistent, but both showed the rich genetic diversity of pitaya germplasm, and suitable parents could be selected according to the classification results and breeding purposes.

Cite this article

CHEN Ming-xian . Genetic Diversity Analysis of Pitaya Germplasm Based on ISSR Markers and Quantitative Traits[J]. Subtropical Plant Science, 2022 , 51(2) : 118 -124 . DOI: 10.3969/j.issn.1009-7791.2022.02.005

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