研究报告

早熟砂梨ISSR-PCR反应体系的建立与优化

  • 宋燕春 ,
  • 李永裕 ,
  • 陈建烟 ,
  • 黄添毅 ,
  • 龚 理 ,
  • 吴少华
展开
  • 福建农林大学园艺学院,福建 福州 350002
宋燕春(1986-),男,四川泸州人,硕士研究生,从事园艺植物分子生物学研究。

收稿日期: 2013-01-19

  修回日期: 2013-01-19

  网络出版日期: 2013-06-10

基金资助

高等学校博士学科点专项科研基金(20113515110011)、福建省科技计划重点项目(2012N0005)

Establishment and Optimization of ISSR-PCR Reaction System in Precocious Pyrus pyrifolia

  • SONG Yan-chun ,
  • LI Yong-yu ,
  • CHEN Jian-yan ,
  • HUANG Tian-yi ,
  • GONG Li ,
  • WU Shao-hua
Expand
  • College of Horticulture, Fujian Agriculture and Forestry University, Fuzhou 350002, Fujian China

Received date: 2013-01-19

  Revised date: 2013-01-19

  Online published: 2013-06-10

摘要

以我国南方主栽的早熟砂梨品种‘翠冠’Pyrus pyrifolia ‘Cuiguan’为材料,对ISSR技术体系中的模板DNA浓度、Taq DNA聚合酶用量、引物浓度、dNTP浓度、Mg2+浓度、退火温度、PCR循环数等7个主要因素进行优化和筛选,建立了适合早熟砂梨的ISSR-PCR反应体系。最终反应体系为20 μL体系中10×PCR buffer(不含Mg2+)2 μL,模板DNA浓度60 ng,TaqDNA聚合酶0.75 U,引物浓度1 μmol/L,dNTP浓度90 μmol/L,Mg2+浓度2.25 mmol/L。扩增程序为:预变性94 ℃ 5 min,变性94 ℃ 45 s,退火45 s,72 ℃延伸1 min,共42个循环,然后72 ℃再延伸10 min,4 ℃保存,用1.5%琼脂糖凝胶电泳检测多态性。

关键词: 早熟; 砂梨; ISSR; 体系优化

本文引用格式

宋燕春 , 李永裕 , 陈建烟 , 黄添毅 , 龚 理 , 吴少华 . 早熟砂梨ISSR-PCR反应体系的建立与优化[J]. 亚热带植物科学, 2013 , 42(02) : 91 -96 . DOI: 10.3969/j.issn.1009-7791.2013.02.001

Abstract

To obtain 7 factors (DNA template dosage, Taq DNA polymerase dosage, primer concentration, dNTP concentration, Mg2+ concentration, annealing temperature and PCR cycles ) of ISSR-PCR Reaction System in Pyrus pyrifolia ‘Cuiguan’, a precocious cultivar of southern China was been used as template. An optimum reaction system was been established. The final total volume was 20 μL, contains 2 μL 10×PCR buffer (Mg2+ free), 60 ng DNA template, 0.5 U Taq DNA polymerase, 1 μmol/L of primer concentration, 90 μmol/L of dNTP concentration, 2.25 mmol/L of Mg2+ concentration. Amplication procedure was as follows: initial-denaturing of 5 min at 94 ℃, followed by 42 cycles of 45 s for denaturing at 94 ℃, at annealing temperature for 45 s and 1 min at 72 ℃, after that 10 min extending at 72 ℃, and then keep at 4 ℃. Use 1.5% of agarose gel electrophoresis to test the genetic polymorphism.

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