植物生理生化与分子生物学

福建省枳椇种质资源遗传多样性RAPD分析

  • 黄 雯 ,
  • 胡应平 ,
  • 李阿池 ,
  • 杨志坚 ,
  • 明艳林 ,
  • 陈 辉
展开
  • (1.福建省亚热带植物研究所,福建省亚热带植物生理生化重点实验室,福建 厦门 361006;2.福建农林大学林学院,福建 福州 350002;3.漳州市速生丰产林基地管理中心,福建 漳州 363000)
黄雯,硕士,助理研究员,从事植物遗传育种研究。

收稿日期: 2016-06-27

  修回日期: 2016-10-12

  网络出版日期: 2016-09-10

基金资助

福建省科技创新平台建设项目(2010N2001)

RAPD Analysis on the Genetic Diversity of Hovenia acerba in Fujian Province

  • HUANG Wen ,
  • HU Ying-Ping ,
  • LI A-Chi ,
  • YANG Zhi-Jian ,
  • MING Yan-Lin ,
  • CHEN Hui-
Expand
  • (1.Fujian Key Laboratory of Physiology and Biochemistry for Subtropical Plant, Fujian Institute of Subtropical Botany, Xiamen 361006, Fujian China; 2.College of Forestry, Fujian Agriculture and Forestry University, Fuzhou 350002, Fujian China; 3.Zhangzhou Fast-growing Forest Management Center, Zhangzhou 363000, Fujian China)

Received date: 2016-06-27

  Revised date: 2016-10-12

  Online published: 2016-09-10

摘要

建立和优化枳椇Hovenia acerba的RAPD反应体系,并对福建省12个种源地35份枳椇材料进行遗传多样性及亲缘关系研究。利用筛选出的10个RAPD引物共检测基因组DNA中193个位点,其中多态性位点161个(83.42%)。供试材料观测等位基因数(Na)1.8342、有效等位基因数(Ne)1.4155,Nei’s基因多样性(H)0.2493,Shannon多样性指数(I)0.3822。以遗传相似系数0.754为阈值,可将35份枳椇分成五大组。RAPD标记可有效揭示福建省枳椇种质资源的遗传多样性,所测枳椇种质资源遗传多样性丰富,极具开发利用价值。

关键词: 福建; 枳椇; RAPD; 遗传多样性

本文引用格式

黄 雯 , 胡应平 , 李阿池 , 杨志坚 , 明艳林 , 陈 辉 . 福建省枳椇种质资源遗传多样性RAPD分析[J]. 亚热带植物科学, 2016 , 45(03) : 242 -247 . DOI: 10.3969/j.issn.1009-7791.2016.03.010

Abstract

The methods of RAPD molecular markers were used to study genetic diversity and the genetic relationship of 35 germplasms of Hovenia acerba from 12 provenances. The reaction system of RAPD fitting for analyzing the genetic diversity of H. acerba were established and optimized. The results showed that 193 locus of genomic DNA in total were detected in 10 RAPD primers, of which there were 161 polymorphic locus (83.42%). The number of alleles (Na) was 1.8342, the effective number of alleles (Ne) was 1.4155, Nei’s gene diversity (H) was 0.2493, Shannon’s information index (I) was 0.3822. UPGMA cluster analysis showed that the similarity coefficient is about 0.754, the 35 copies of H. acerba germplasms could be classified into 5 groups. RAPD molecular markers could well reflect genetic differences and the genetic diversity among H. acerba. Thirty-five materials measured from 12 provenances of H. acerba showed abundant genetic diversity, which had great potential for exploitation and utilization.?

参考文献

[1] 黄雯,林富聪,张庆美. 珍稀树种枳椇研究现状与应用前景[J]. 福建热作科技, 2010,35(3): 44—48.
[2] 金光,陈志峰,廖汝玉,柯冠武. 福建野生枳椇资源的现状及开发利用前景[J]. 福建果树, 2006(3): 29—30.
[3] 谭云,李忠海,黎继烈,贾媛. RAPD分子标记技术在植物研究上的应用[J]. 安徽农业科学, 2013,41(25): 10236—10238.
[4] 郑超,别庆铃,夏冰,彭峰,汪仁,郑玉红. 4 种红豆杉属植物遗传多样性和遗传关系的RAPD分析[J]. 植物资源与环境学报, 2013,22(3): 58—62.
[5] 肖猛,李群,郭亮,唐琳,王丽,陈放. 四川西部濒危植物桃儿七遗传多样性的RAPD分析[J]. 生态学报, 2015,35(5): 1488—1495.
[6] 尹静静,李效尊,阴筱,朱其松,赵庆雷,刘蓬,吴修. 山东莲藕(Nelumbo nucifera Gaertn.)种质资源的RAPD 鉴定和遗传多样性分析[J]. 分子植物育种, 2015,13(6): 1323—1328.
[7] 赵鹏,雍晓鹏,胡国臣,吕婷,焦培培. 濒危植物新疆沙冬青遗传多样性的RAPD分析[J]. 干旱区资源与环境, 2016,30(3): 74—79.
[8] 黄丽芳,董云萍,王晓阳,陈鹏,林兴军,范睿,闫林. 利用RAPD标记分析咖啡种质资源的遗传多样性[J]. 热带作物学报, 2014,35(12): 2313—2319.
[9] Kumar H, Priya P, Singh N, Kumar M, Choudhary B K, Kumar L, Singh I S, Kumar N. RAPD and ISSR marker-based comparative evaluation of genetic diversity among indian germplasms of euryale ferox: an aquatic food plant[J]. Applied Biochemistry and Biotechnology, 2016,11(7): e0159050.
[10] Ezzat S M, El Sayed A M , Salama M M. Use of random amplified polymorphic DNA (RAPD) technique to study the genetic diversity of eight aloe species[J]. Planta Medica, 2016: DOI 10.1055/s-0042-108208.
[11] Costa L S, Reiniger L R S, Heinzmann B M, Amaral L P, Serrote C M L. Study of the genetic diversity and structure of a natural population of Nectandra megapotamica (Spreng.) Mez. using RAPD markers[J]. Genetics and Molecular Research, 2015,14 (4): 18407—18413.
[12] 李欢,张德志. 枳椇属植物中的化学成分及提取技术研究进展[J]. 亚太传统医药, 2010,6(11): 172—174.
[13] 嵇扬,陆红. 枳椇子药理研究概况[J]. 中医药学报, 2002,30(1): 54 —56.
[14] 张晶,李慧萍,弓晓杰,陈全程,郑毅男. 枳椇属植物化学成分及生物活性研究进展[J]. 天然产物研究与开发, 2006,18(4): 674—680.
[15] 张俊钦. 乡土树种枳椇栽培效果研究[J]. 林业勘察设计, 2015(1): 153—156.
[16] 王朝霞. 珍稀树种枳椇的生态习性及繁殖栽培与利用[J]. 黑龙江农业科学, 2008(5): 105—107.
[17] 丁向阳. 枳椇的生态适应性及栽培技术研究[J]. 湖南林业科技, 2004,31(6): 39—41.
[18] 李守勇,续九如,孙浩元. 不同产地冬枣的RAPD分析[J]. 西北林学院学报, 2006,21(5): 89—93.
[19] 李瑞环,李新岗,黄建,高文海,张亚利. 枣树基因组DNA 提取及其RAPD体系优化[J]. 安徽农业科学, 2007,35(17): 5102—5104.
文章导航

/