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海水胁迫下黄秋葵种子发芽率的全基因组关联分析
华鑫涛, 汤子祺, 杨 芸, 张 妍, 李慧雯, 李奕莹, 束杨培, 孙 健, 谢冬微
2026, 55(1):
12-26.
DOI: 10.3969/j.issn.1009-7791.2026.01.002
以不同来源的180份黄秋葵Abelmoschus esculentus种质资源为材料,对其种子进行3‰和6‰盐度海水处理,测定发芽率及相对发芽率,并与SNP标记进行全基因组关联分析(GWAS),结合转录组测序(RNA-seq)筛选耐盐候选基因。结果表明,3‰和6‰盐度海水对黄秋葵种子发芽率均产生不同程度的抑制作用。GWAS共筛选出75个与耐盐性状显著相关的SNP位点。在54号染色体上检测到一个关联区间,该区间有4个SNP位点在3‰和6‰盐度海水胁迫下均被同时检测到,是控制相对发芽率耐盐性的重要位点,4个SNP上下游100 kb范围内共有54个注释基因。利用黄秋葵苗期海水胁迫转录组测序数据,筛选出6个差异表达基因作为海水胁迫下黄秋葵耐盐性的候选基因,分别为Ae54G020550、Ae54G020570、Ae54G020630、Ae54G020730、Ae54G020810和Ae54G020890,注释功能分别为细胞骨架组成结构、编码CYSTM蛋白、NPH3或BTB/POZ蛋白、醇脱氢酶、富含亮氨酸的重复序列及PPR家族蛋白。研究结果为分析黄秋葵耐盐基因的功能及其耐盐性分子机制提供参考。
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